Protein–RNA interactions for Protein: A7E2U8

C4orf47, UPF0602 protein C4orf47, humanhuman

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf47A7E2U8 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CRTC2-202ENST00000368630 1635 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 NFE2-201ENST00000312156 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 ROPN1-202ENST00000405845 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
C4orf47A7E2U8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms