Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL136309.2-201ENST00000427049 2277 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CFAP69A5D8W1 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms