Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4P1

ATG4B, Cysteine protease ATG4B, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4BQ9Y4P1 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
ATG4BQ9Y4P1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
ATG4BQ9Y4P1 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms