Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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HDGFL3Q9Y3E1 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
HDGFL3Q9Y3E1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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