Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2K6

USP20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 20, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP20Q9Y2K6 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CPSF6-203ENST00000456847 1915 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 HPN-201ENST00000262626 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
USP20Q9Y2K6 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.6 ms