Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPM6

LHX6, LIM/homeobox protein Lhx6, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX6Q9UPM6 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 FXNP2-201ENST00000411625 547 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL669831.5-220ENST00000412115 581 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SYNPR-202ENST00000450542 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL049835.1-201ENST00000555850 514 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC109809.1-201ENST00000619665 545 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 AC006927.4-201ENST00000639187 543 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
LHX6Q9UPM6 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
LHX6Q9UPM6 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms