Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNG2

TNFSF18, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 18, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF18Q9UNG2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A12-203ENST00000377572 2887 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PPHLN1-201ENST00000256678 1820 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 FLAD1-205ENST00000368431 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CBLC-202ENST00000341505 1441 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A15-202ENST00000369503 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ZMYM3-204ENST00000373982 1867 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TJP3-207ENST00000589378 3068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ZFP1-208ENST00000568079 1426 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SRD5A3-201ENST00000264228 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 STOML1-206ENST00000561656 1833 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 LRRC17-202ENST00000339431 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
TNFSF18Q9UNG2 BUD13-202ENST00000375445 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms