Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB23Q9ULC3 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB23Q9ULC3 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 GLI4-203ENST00000517468 963 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB23Q9ULC3 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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RAB23Q9ULC3 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB23Q9ULC3 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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RAB23Q9ULC3 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PRM2-201ENST00000241808 680 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 PRM2-202ENST00000435245 723 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB23Q9ULC3 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
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