Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL01

DSE, Dermatan-sulfate epimerase, humanhuman

Predictions only

Length 958 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSEQ9UL01 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
DSEQ9UL01 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NDUFAF2-203ENST00000511107 586 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZNF408-201ENST00000311764 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
DSEQ9UL01 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms