Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKB3

DNAJC12, DnaJ homolog subfamily C member 12, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC12Q9UKB3 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 FHAD1-205ENST00000375997 1459 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
DNAJC12Q9UKB3 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
DNAJC12Q9UKB3 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 505.8 ms