Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIA0

CYTH4, Cytohesin-4, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH4Q9UIA0 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC105202.1-204ENST00000502167 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZNF398-203ENST00000483892 2121 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
CYTH4Q9UIA0 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms