Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGP4

LIMD1, LIM domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMD1Q9UGP4 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC123567.1-201ENST00000548294 1261 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SNX12-206ENST00000622259 661 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 KLRG1-201ENST00000266551 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FAM86MP-201ENST00000340703 885 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NOP53-AS1-201ENST00000602048 540 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
LIMD1Q9UGP4 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms