Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FBXL16-201ENST00000324361 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FADS3-204ENST00000525588 1254 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CERKL-206ENST00000410087 3208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RFX2-222ENST00000592546 2578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SAFB-201ENST00000292123 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SGK2-201ENST00000341458 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SPOCK3-210ENST00000506886 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 CALHM1-201ENST00000329905 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TPD52-201ENST00000379096 4041 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 ARMC5-202ENST00000408912 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
NKX1-2Q9UD57 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LAT2-205ENST00000460943 2527 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NDUFA11-202ENST00000418389 2406 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
NKX1-2Q9UD57 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.7 ms