Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP0

SPAST, Spastin, humanhuman

Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPASTQ9UBP0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
SPASTQ9UBP0 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC006277.1-201ENST00000624348 1610 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC002310.2-201ENST00000486926 950 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
SPASTQ9UBP0 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms