Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2E5

CHPF2, Chondroitin sulfate glucuronyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 772 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHPF2Q9P2E5 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 FOLR3-204ENST00000611028 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CHPF2Q9P2E5 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C5orf66-202ENST00000507641 547 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 FAM166B-201ENST00000399742 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
CHPF2Q9P2E5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms