Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0J1

PDP1, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 1, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP1Q9P0J1 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SSR4P1-203ENST00000599569 2260 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 POLR3D-202ENST00000397802 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CNTNAP3-202ENST00000358144 4885 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AP000866.1-201ENST00000499143 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 RGS3-206ENST00000374136 2092 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 TRIM67-202ENST00000444294 9320 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
PDP1Q9P0J1 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms