Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV96

TMEM30A, Cell cycle control protein 50A, humanhuman

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Length 361 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM30AQ9NV96 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 BNIP3P1-202ENST00000550043 1585 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 KCTD12-201ENST00000377474 6225 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC010507.1-202ENST00000633286 381 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ASAP3-212ENST00000618240 2226 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 AL163636.2-201ENST00000553909 1498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
TMEM30AQ9NV96 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
TMEM30AQ9NV96 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
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