Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUW8

TDP1, Tyrosyl-DNA phosphodiesterase 1, humanhuman

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Length 608 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDP1Q9NUW8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
TDP1Q9NUW8 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RBFOX3-212ENST00000584778 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FARP1-242ENST00000627049 5103 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AL096870.1-201ENST00000555591 930 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 EI24-214ENST00000620753 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LCE5A-201ENST00000334269 819 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
TDP1Q9NUW8 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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