Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MIOS-202ENST00000405785 3095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LHX9Q9NQ69 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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LHX9Q9NQ69 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LHX9Q9NQ69 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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