Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 UBXN11-204ENST00000374217 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ARFGAP1-203ENST00000370283 3281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LINC00391-201ENST00000433569 1844 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
HMG20AQ9NP66 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
HMG20AQ9NP66 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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