Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD90

NEUROD4, Neurogenic differentiation factor 4, humanhuman

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD4Q9HD90 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
NEUROD4Q9HD90 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms