Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAZ1

CLK4, Dual specificity protein kinase CLK4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK4Q9HAZ1 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 WBP2-215ENST00000591399 2225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CLK4Q9HAZ1 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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