Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AL355864.2-201ENST00000447420 863 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 DERL2-202ENST00000570848 657 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
FOXQ1Q9C009 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 MTX3-202ENST00000512528 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
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FOXQ1Q9C009 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 UEVLD-201ENST00000300038 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 MBP-203ENST00000359645 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 CGB8-201ENST00000448456 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
FOXQ1Q9C009 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
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