Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV7

BCO2, Beta,beta-carotene 9',10'-oxygenase, humanhuman

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCO2Q9BYV7 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
BCO2Q9BYV7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.4 ms