Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQS8

FYCO1, FYVE and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FYCO1Q9BQS8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 FUT8-213ENST00000557164 2269 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FYCO1Q9BQS8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC00221-201ENST00000603633 1656 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL607033.1-201ENST00000623900 1599 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 GOLIM4-201ENST00000309027 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AKAP9-205ENST00000394564 1356 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC025183.2-201ENST00000503386 428 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ABBA01031660.1-201ENST00000635219 756 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 MYLK3-202ENST00000536476 1795 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FYCO1Q9BQS8 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms