Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AC106795.3-201ENST00000511650 547 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
LPIN3Q9BQK8 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LPIN3Q9BQK8 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms