Protein–RNA interactions for Protein: Q99536

VAT1, Synaptic vesicle membrane protein VAT-1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAT1Q99536 DUSP13-210ENST00000491677 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
VAT1Q99536 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PDE4C-202ENST00000355502 5979 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
VAT1Q99536 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms