Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 TEX13B-201ENST00000302917 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 THEMIS2-204ENST00000373927 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 AL132639.3-201ENST00000556537 530 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PHOX2BQ99453 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 GTF2H2-204ENST00000517900 659 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 TSPAN4-201ENST00000346501 882 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 RPS2P36-201ENST00000456516 831 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PHOX2BQ99453 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms