Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ZNF767P-206ENST00000513792 565 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 SNRPD3-201ENST00000215829 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TMEM44-AS1-203ENST00000453671 1119 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 C18orf21-207ENST00000610527 1059 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 C18orf21-208ENST00000618334 856 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
LRRIQ1Q96JM4 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 BLOC1S1-205ENST00000551926 531 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AL160035.1-201ENST00000637583 576 ntTSL 4 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 SNHG20-204ENST00000566583 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 IL11RA-202ENST00000441545 1700 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TUBA3E-201ENST00000312988 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MPP2-208ENST00000520305 2111 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 P2RY4-201ENST00000374519 1595 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 SPAG11B-203ENST00000359758 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LRRIQ1Q96JM4 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
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