Protein–RNA interactions for Protein: Q96GS4

BORCS6, BLOC-1-related complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BORCS6Q96GS4 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
BORCS6Q96GS4 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms