Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ADORA1-203ENST00000367235 2219 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SHANK3-201ENST00000262795 7091 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 NFATC4-201ENST00000250373 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
FAF2Q96CS3 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms