Protein–RNA interactions for Protein: Q95604

HLA-C, HLA class I histocompatibility antigen, Cw-17 alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-CQ95604 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HLA-CQ95604 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DMAC2-202ENST00000301183 1134 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC090386.1-202ENST00000586610 469 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC091812.3-201ENST00000621362 345 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PACS2-203ENST00000447393 6365 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 ATP5C1-201ENST00000335698 1078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FAM197Y7-201ENST00000432892 766 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AL133466.1-201ENST00000447582 150 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 AC020763.1-201ENST00000567186 551 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HLA-CQ95604 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms