Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW27

APOBEC4, Putative C->U-editing enzyme APOBEC-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC4Q8WW27 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GLS2-217ENST00000623608 2518 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
APOBEC4Q8WW27 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
APOBEC4Q8WW27 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms