Protein–RNA interactions for Protein: Q8TF64

GIPC3, PDZ domain-containing protein GIPC3, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GIPC3Q8TF64 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KIFC3-207ENST00000543930 3018 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ADGRE2-208ENST00000595839 2046 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TCP10-202ENST00000397829 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DNM1-203ENST00000393594 3245 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
GIPC3Q8TF64 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
GIPC3Q8TF64 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.5 ms