Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDG4

HELQ, Helicase POLQ-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HELQQ8TDG4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 NDUFA3-204ENST00000391764 267 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 HAUS2-211ENST00000639412 375 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
HELQQ8TDG4 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms