Protein–RNA interactions for Protein: Q8TDD5

MCOLN3, Mucolipin-3, humanhuman

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3Q8TDD5 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MCOLN3Q8TDD5 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
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MCOLN3Q8TDD5 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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MCOLN3Q8TDD5 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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MCOLN3Q8TDD5 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
MCOLN3Q8TDD5 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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