Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCD3

HJURP, Holliday junction recognition protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HJURPQ8NCD3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
HJURPQ8NCD3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 DTD2-202ENST00000356180 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 KIAA0895-207ENST00000436884 1952 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ZDHHC20-IT1-201ENST00000417513 440 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MIR3197-201ENST00000582241 73 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
HJURPQ8NCD3 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 226.8 ms