Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F7

GCSAM, Germinal center-associated signaling and motility protein, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSAMQ8N6F7 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RAB7A-204ENST00000483906 533 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 GFAP-233ENST00000639277 1783 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
GCSAMQ8N6F7 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms