Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 AC012158.2-201ENST00000536546 354 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL691459.1-201ENST00000438589 407 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 VCX3B-201ENST00000381029 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TMBIM4-208ENST00000542724 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CELF4-221ENST00000601019 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CD8B-204ENST00000393759 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RGS5-214ENST00000429865 754 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ITGA9-AS1-205ENST00000438136 578 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL606489.1-201ENST00000443515 486 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 REEP5-205ENST00000504247 480 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 REEP5-207ENST00000513339 1139 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KRT16P3-202ENST00000580113 1012 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KRT16P1-203ENST00000581027 1012 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FTLP5-201ENST00000586853 534 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GHRHR-212ENST00000611037 923 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC138466.4-201ENST00000623965 852 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ERGIC3-203ENST00000357394 1357 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 FAM27C-201ENST00000377542 616 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-13-201ENST00000390602 430 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC026410.1-201ENST00000507366 1101 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC100810.1-201ENST00000518822 978 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MRPL51-202ENST00000537701 601 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RPL19-207ENST00000582193 792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RPL17P45-201ENST00000586289 509 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AL023803.2-201ENST00000620080 638 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ZFYVE19-203ENST00000355341 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 ACTBP7-201ENST00000418351 1124 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC136604.1-201ENST00000418535 575 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 EHMT2-AS1-201ENST00000434689 373 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
LTBP4Q8N2S1 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
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