Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z398

ZNF550, Zinc finger protein 550, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF550Q7Z398 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ZNF550Q7Z398 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ZNF550Q7Z398 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms