Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 RETN-201ENST00000221515 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MS4A13-201ENST00000378185 808 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 KLF2P4-201ENST00000451959 1225 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SLC25A47P1-201ENST00000531577 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
HECW1Q76N89 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CLUHP6-201ENST00000580789 941 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AL158154.2-201ENST00000585776 2208 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PRKN-201ENST00000338468 1276 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PHKG1P2-201ENST00000457537 863 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 PLSCR4-204ENST00000446574 1442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
HECW1Q76N89 ATF5-205ENST00000600336 682 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms