Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ4

USP31, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 31, humanhuman

Predictions only

Length 1,352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP31Q70CQ4 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MON1B-203ENST00000545553 1814 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 VCX3B-204ENST00000453306 868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SNHG6-201ENST00000520348 648 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 REXO1L1P-202ENST00000608646 1974 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TSFM-201ENST00000323833 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ROPN1-207ENST00000484329 566 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AL160313.1-201ENST00000502101 1039 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 DDX55-203ENST00000421670 1574 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 MRPL58-201ENST00000301585 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RPS24-203ENST00000435275 656 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 RORA-AS1-205ENST00000559824 761 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP31Q70CQ4 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms