Protein–RNA interactions for Protein: Q6STE5

SMARCD3, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 3, humanhuman

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Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCD3Q6STE5 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
SMARCD3Q6STE5 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
SMARCD3Q6STE5 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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