Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2C8

MED27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED27Q6P2C8 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ZNF418-208ENST00000599852 2501 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
MED27Q6P2C8 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
MED27Q6P2C8 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms