Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PKP4-AS1-203ENST00000629904 1951 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 AC068831.3-201ENST00000553321 1858 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
LETMD1Q6P1Q0 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms