Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 GTF2H2C-201ENST00000380729 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CCT7-216ENST00000540468 1674 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CXorf38-201ENST00000327877 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SOX14-201ENST00000306087 2055 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 QRFP-202ENST00000623824 1658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
ANKRD40Q6AI12 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms