Protein–RNA interactions for Protein: Q5VVW2

GARNL3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,013 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3Q5VVW2 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC004865.2-202ENST00000444348 852 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 PNMT-202ENST00000394246 821 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
GARNL3Q5VVW2 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms