Protein–RNA interactions for Protein: Q5SW79

CEP170, Centrosomal protein of 170 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 1,584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP170Q5SW79 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CEP170Q5SW79 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 FANCA-204ENST00000534992 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC131235.3-202ENST00000608135 362 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SLC44A3-206ENST00000527077 1943 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AL445430.1-201ENST00000419796 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC068473.4-201ENST00000587527 585 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 HIST3H3-201ENST00000366696 481 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 C17orf50-202ENST00000604830 477 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CEP170Q5SW79 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms