Protein–RNA interactions for Protein: Q5BLP8

C4orf48, Neuropeptide-like protein C4orf48, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf48Q5BLP8 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FAM118B-201ENST00000360194 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL360295.1-201ENST00000425435 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TOMM7-202ENST00000372879 514 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC011997.1-201ENST00000409845 1032 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 EBLN1-201ENST00000422359 1208 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC00458-201ENST00000423442 1060 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PRELID3BP10-201ENST00000431957 584 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC073174.1-201ENST00000444155 415 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL732323.1-201ENST00000445897 456 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AL512785.1-201ENST00000447899 517 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC008770.1-204ENST00000489336 622 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC096736.1-201ENST00000512609 947 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC02296-201ENST00000557070 544 ntTSL 4 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC106785.3-201ENST00000564064 847 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 HAR1B-202ENST00000608031 773 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 AC068792.1-201ENST00000621354 417 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC00682-204ENST00000637677 931 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 LINC00384-201ENST00000437721 6852 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ANGPT2-202ENST00000338312 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 CAMK2D-213ENST00000514328 1497 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 COL4A1-201ENST00000375820 6532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 NALCN-AS1-201ENST00000457843 2846 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SYNGAP1-208ENST00000629380 9862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 ANTXR2-203ENST00000403729 8273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 SUSD6-201ENST00000342745 5388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 PRPF8-205ENST00000572621 7445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
C4orf48Q5BLP8 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 NFATC2-202ENST00000396009 7437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 DHTKD1-201ENST00000263035 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 TMEM159-202ENST00000261388 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 AC026746.1-203ENST00000513386 1676 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 FBXO16-201ENST00000346498 1205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 OR2B3-201ENST00000377173 1106 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
C4orf48Q5BLP8 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms