Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IRAK4-212ENST00000551736 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PCDHA3-202ENST00000532566 4594 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TGFBR3-204ENST00000465892 2908 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC112176.1-201ENST00000565428 3024 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 AC237221.1-202ENST00000563054 2947 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLC14A1-205ENST00000502059 2371 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 BRSK2-202ENST00000382179 3576 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 COG8-206ENST00000306875 4247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 SLIT1-201ENST00000266058 7925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
ANKRD39Q53RE8 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 CCNA1-201ENST00000255465 1879 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FUT6-201ENST00000286955 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PTGR2-204ENST00000555228 2543 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC016245.1-201ENST00000570335 3204 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 RUNX3-201ENST00000308873 3861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AMPD2-218ENST00000528454 2728 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ALDH1B1-201ENST00000377698 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 KRT74-201ENST00000305620 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 AC036214.1-201ENST00000502766 2126 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 LINC02204-201ENST00000630447 3206 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 GIPR-205ENST00000590918 3289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ILF3-202ENST00000407004 3671 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
ANKRD39Q53RE8 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.5 ms